Al termine di una furiosa battaglia per la conquista del potere su Cybertron tra le due fazioni Transformers - Autobots e Decepticons (caratterizzate in modo evidente: buoni i primi, cattivi i secondi) - all'improvviso appare nello spazio un buco nero che minaccia di distruggere l'Universo, e quindi anche il loro pianeta. Grazie ad un'informazione ricevuta da Vector Prime, anziano Transformer, gli Autobot e il loro capo Optimus scoprono l'esistenza del Planet Force, un misterioso potere ancestrale in grado di salvare la Galassia. Ma anche, nel caso cada in mani sbagliate, di conquistarla. Gli Autobot iniziano così una corsa contro il tempo per trovare il Planet Force prima dei Decepticon, anche in questa occasione guidati da Megatron. Nel corso dei loro viaggi, i Transformer incontreranno gli abitanti di diversi pianeti, tra cui anche quelli della Terra.