Yugi è un ragazzo timido e buono che con alcuni suoi amici Joey, Tristan e Téa si diverte nel gioco delle carte fantasy chiamato "Duel Monster" (duello di Mostri) che prevede la lotta fra due mostri. Al termine della lotta fra le due creature, il vincitore viene nominato il re dei giochi, che in gergo viene chiamato Yu-Gi-Oh. Yugi che ama risolvere indovinelli ed enigmi, viene a conoscenza di un antico gioco di carte risalente al periodo degli egizi chiamato "Millennium Puzzle". Questo gioco gli è stato presentato dal nonno che gestisce anche un negozio di giocattoli e quindi di carte. Yugi riesce a risolvere il segreto dell'antico Egyptian Millennium Puzzle (Puzzle Egiziano Millenario) e si trasforma in Yami Yugi, un potente spirito di un antico re egiziano, il più potente Yu-Gi-Oh. Partitio per un viaggio al fine di diventare King of Duelists, cioè il re dei duellanti, combatterà contro avversari, potenti e mostruosi secondo le loro regole, ma riuscirà sempre a sconfiggerli nonostante molteplici difficoltà. Il nemico numero uno di Yugi è Kaiba Seto un ricco ragazzo, esperto nell'arte dei combattimenti di carte. Insieme a suo fratello minore Mokuba, combatte contro Yugi, spesso usando anche le maniere scorrette.