À la fin d'une furieuse bataille pour le pouvoir sur Cybertron entre les deux factions Transformers - Autobots et Decepticons (clairement caractérisés: le premier bon, le dernier mauvais) - soudain un trou noir apparaît dans l'espace qui menace de détruire l'Univers, et donc aussi leur planète. Grâce à une information reçue de Vector Prime, l'aîné Transformer, les Autobots et leur chef Optimus découvrent l'existence de la Planet Force, une mystérieuse puissance ancestrale capable de sauver la Galaxie. Mais aussi, au cas où il tomberait entre de mauvaises mains, pour le conquérir. Les Autobots entament ainsi une course contre la montre pour retrouver la Planet Force avant les Decepticons, toujours menés par Megatron. Au cours de leurs voyages, les Transformers rencontreront les habitants de différentes planètes, y compris celles de la Terre.