På slutten av en rasende kamp om makten over Cybertron mellom de to Transformers-fraksjonene - Autobots og Decepticons (tydelig karakterisert: førstnevnte gode, sistnevnte dårlige) - vises plutselig et svart hull i rommet som truer med å ødelegge universet, og derfor også deres planet. Takket være informasjon mottatt fra Vector Prime, oppdager eldste Transformer, Autobots og deres leder Optimus eksistensen av Planet Force, en mystisk forfedres kraft som er i stand til å redde Galaxy. Men også, i tilfelle det faller i feil hender, å erobre det. Autobots starter dermed et løp mot tiden for å finne Planet Force før Decepticons, igjen ledet av Megatron. Under sine reiser vil Transformers møte innbyggerne på forskjellige planeter, inkludert de på jorden.