I slutet av en rasande strid om makten på Cybertron mellan de två Transformers-fraktionerna - Autobots och Decepticons (tydligt kännetecknat: det tidigare bra, det senare dåligt) - plötsligt dyker ett svart hål upp i rymden som hotar att förstöra universum och därför också deras planet. Tack vare informationen från Vector Prime upptäcker en äldre Transformer, Autobots och deras ledare Optimus existensen av Planet Force, en mystisk förfädersmakt som kan rädda Galaxy. Men också, om det hamnar i fel händer, att erövra det. Autobots inleder således ett lopp mot tiden för att hitta Planet Force före Decepticons, också vid detta tillfälle under ledning av Megatron. Under sina resor kommer Transformers att möta invånarna på olika planeter, inklusive de på jorden.